2024-2025
Avenue Victor Maistriau 8a
7000 Mons
Fiche ects de l'unité d'enseignement #2390 intitulée :
Modélisation bioinformatique
Bachelier en sciences de l'ingénieur industriel / Bloc 3
- groupe technologies des données du vivant
Master en Sciences de l'Ingénieur industriel orientation Life data technologies / Cycle 2 Bloc Complémentaire
- Passerelle Info
- Passerelle Bio/Chimie/Agro
Informations
Responsable d'UE : David COORNAERT
Bloc : BAC3 TL, MA0 LDT
Période : 2e quadrimestre
Durée : 52 h
Crédits : 4 ects
UE Prérequises :
- Techniques Bioinformatique 1
UE Corequises : aucune
Activités d'apprentissage (AA)
- Compléments de techniques bioinformatiques : 24 h, David COORNAERT
- Modélisation des systèmes biologiques : 28 h, David COORNAERT
Connaissances et compétences préalables
-
Contribution aux objectifs du référentiel de compétences de l'ARES
- Compétences disciplinaires
- Mobiliser des concepts des sciences fondamentales afin de résoudre des problèmes spécifiques aux sciences et techniques de l’ingénieur.
- Valider une théorie ou un modèle par la mise en place d’une démarche expérimentale.
- Mobiliser les outils mathématiques nécessaires à la résolution de problèmes complexes et notamment lors de la modélisation.
- Mettre en œuvre des techniques d’algorithmique et de programmation et utiliser les outils numériques spécifiques aux sciences et techniques de l’ingénieur.
- Compétences transversales et linguistiques
- S’auto évaluer et agir de façon réflexive, autonome et responsable.
- Travailler en équipe au service d’un projet.
- Identifier et sélectionner diverses ressources spécialisées pour documenter un sujet.
- Analyser une situation en adoptant une démarche scientifique.
- Communiquer de façon adéquate en fonction du public cible, en français et en langue étrangère en utilisant les outils appropriés.
Acquis d'apprentissage spécifiques
identifier les situations où les techniques de modélisation seraient bénéfiques, sélectionner les plus appropriées et les implémenter.
Contenu des AA
Compléments de techniques bioinformatiques
Ce cours rassemblera les éléments informatiques non encore découverts trop petits pour constituer une AA en soi, essentiellement des librairies modulaires adjointes à Python par exemple, permettant diverses tâches telle que la connection de Python au base de données *SQL, la distribution de tâches (calcul distribué), la génération de graphes depuis python etc etc, la parallèlisation ...
Modélisation des systèmes biologiques
Les techniques dites de "modélisation", complémentaires de l'approche expérimentale, complètent l'analyse biologique principalement en simulant sur ordinateur des parties de systèmes biologiques. La répétition de ces simulations permettant, on l'espère, d'approfondir l'analyse. Il existe une pléthore de techniques, pas très différentes des techniques pompeusement dites "d'intelligence artificielle", qu'on devrait plus honnêtement appeler "modèle paramètriques".
Répartition des heures
Compléments de techniques bioinformatiques : 10 h de théorie, 14 h d'exercices/Labos
Modélisation des systèmes biologiques : 16 h de théorie, 12 h d'exercices/Labos
Méthodes d'enseignement
Compléments de techniques bioinformatiques : cours magistral, travaux de groupes, approche par situation problème, étude de cas, utilisation de logiciels
Modélisation des systèmes biologiques : cours magistral, travaux de groupes, approche par situation problème, étude de cas, utilisation de logiciels
Langues d'enseignement
Compléments de techniques bioinformatiques : français
Modélisation des systèmes biologiques : français
Supports
Compléments de techniques bioinformatiques : copies de présentations, notes de cours, notes d'exercices, protocoles de laboratoires
Modélisation des systèmes biologiques : copies de présentations, notes de cours, notes d'exercices, protocoles de laboratoires
Ressources bibliographiques
Compléments de techniques bioinformatiques
-
Modélisation des systèmes biologiques
-
Évaluation et pondération
Méthode d'évaluation : note globale à l'UE
Langues d'évaluation : français
Modalités d'évaluation :
Oral + Pratique
Report de note d'une année à l'autre pour l'AA réussie en cas d'échec à l'UE :
- Compléments de techniques bioinformatiques : non
- Modélisation des systèmes biologiques : non