Fiche ects de l'unité d'enseignement #338 intitulée :
Techniques Bioinformatiques
Bachelier en Biotechnique / Bloc 2
Informations
Responsable d'UE : David COORNAERT
Bloc : BIO2
Période : 1er quadrimestre
Durée : 30 h
Crédits : 3 ects
UE Prérequises :
- Résolution de problèmes bioinformatiques
UE Corequises : aucune
Activité d'apprentissage (AA)
- Techniques bioinformatiques : 30 h, David COORNAERT
Connaissances et compétences préalables
-
Contribution aux objectifs du référentiel de compétences de l'ARES
- Communiquer et informer
- Utiliser le vocabulaire adéquat
- Collaborer à la conception, à l’amélioration et au développement de projets techniques
- Analyser une situation donnée sous ses aspects techniques et scientifiques
- Rechercher et utiliser les ressources adéquates
- Proposer des solutions qui tiennent compte des contraintes
- S’engager dans une démarche de développement professionnel
- Développer une pensée critique
- Apporter les solutions techniques en réponse aux questionnements spécifiques dans le domaine biologique
- Exploiter les connaissances de base des sciences du vivant.
- Préparer l’analyse et l’exploitation des résultats des dispositifs de collecte de données
Acquis d'apprentissage spécifiques
Maitrise des outils fondamentaux de linux dans la manipulation des fichiers de banques de données documentaires au niveau du shell
Contenu de l'AA
Découverte et exploitation des outils fondamentaux de linux (wget, lftp, grep, sed, awk ..) et leurs usages dans le cadre de la bioinformatique.
Combinaison de ces outils avec les programmes de base inclus dans la suite logicielle emboss
Répartition des heures
10 h de théorie, 20 h d'exercices/Labos
Méthodes d'enseignement
Cours magistral, approche interactive, approche par situation problème, étude de cas, utilisation de logiciels
Langues d'enseignement
Français
Supports
Notes d'exercices
Ressources bibliographiques
Évaluation et pondération
Méthode d'évaluation : note aux AA
Langues d'évaluation :
- Techniques bioinformatiques : français
Pondération par AA :
- Techniques bioinformatiques : 100 %
Modalités d'évaluation :
Techniques bioinformatiques :