Analyse des données protéomiques : 20 h, Aline LEONET
Connaissances et compétences préalables
Cours de protéomique BA3
Contribution aux objectifs du référentiel de compétences de l'ARES
Identifier, conceptualiser et résoudre des problèmes complexes
Intégrer les savoirs scientifiques et technologiques afin de faire face à la diversité et à la complexité des problèmes rencontrés
Sélectionner et exploiter les logiciels et outils conceptuels les plus appropriés pour résoudre une tâche spécifique
Établir ou concevoir un protocole de tests, de contrôles et de mesures.
Concevoir et gérer des projets de recherche appliquée
Réunir les informations nécessaires au développement de projets de recherche
Réaliser des simulations, modéliser des phénomènes afin d’approfondir les études et la recherche sur des sujets technologiques ou scientifiques
Mener des études expérimentales, en évaluer les résultats et en tirer des conclusions
Valider les performances et certifier les résultats en fonction des objectifs attendus
Exploiter les résultats de recherche
S’intégrer et contribuer au développement de son milieu professionnel
Planifier le travail en respectant les délais et contraintes du secteur professionnel (sécurité …)
Travailler en autonomie et en équipe dans le respect de la culture d’entreprise
Communiquer face à un public de spécialistes ou de non-spécialistes, dans des contextes
nationaux et internationaux
Maitriser les méthodes et les moyens de communication en les adaptant aux contextes et aux publics
S’engager dans une démarche de développement professionnel
Assumer la responsabilité de ses décisions et de ses choix
Acquis d'apprentissage spécifiques
Comprendre les méthodes d'analyse qualitative et quantitative des protéines en spectrométrie de masse.
Traiter, analyser, interpréter les résultats de jeux de donnés issus d'un spectromètre de masse, protéomique, via des logiciels Trans Proteomic pipeline; Skyline, X!tendem, MaxQuant..
Contenu de l'AA
Rappel de l'orginie des données en protéomique et présentation des méthodes d'analyse quantitative des proteines en spectrometrie de masse.
Utiliser des jeux de données issus d'analyseurs en spectrometrie de masse, pour traiter, analyser, interpreter les résultats via des logiciels, Trans Proteomic pipeline, Skyline,.. découverte de l'univers "PROTEOMICS"
Répartition des heures
8 h de théorie, 12 h d'exercices/Labos
Méthodes d'enseignement
Cours magistral, approche par projets, approche par situation problème
Langues d'enseignement
Français
Supports
Copies de présentations, notes d'exercices
Ressources bibliographiques
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Évaluation et pondération
Méthode d'évaluation : note globale à l'UE
Langues d'évaluation : français
Modalités d'évaluation :
Evaluation 100% via la réalisation et présentation d'un projet.